Executando o Gromacs com Facilidade Usando o Singularity Pré-instalado
Aproveitando o poder do Gromacs em um servidor com o Singularity pré-instalado oferece conveniência sem esforço, sem a necessidade de acesso root. Observe que, embora usar o Singularity seja simples, o processo inicial de instalação exige privilégios administrativos - um tópico que não abordaremos nesse guia.
Comandos Essenciais à Sua Disposição: • Construir seu contêiner: `singularity build [Nome] docker://[Imagem]` • Iniciar uma sessão interativa: `singularity shell --nv [Caminho]` • Localizar o GMXRC: `find / -name GMXRC` • Configurar o caminho do Gromacs: `export GROMACS=/usr/local/gromacs/bin.SSE2/gmx_mpi` • Verificar a instalação: `$GROMACS --version`
Recursos Úteis para Explorar: • Documentação do Singularity: docs.sylabs.io/guides/3.5/user-guide/ • Imagens oficiais do Gromacs no Docker: hub.docker.com/r/gromacs/gromacs • Repositório de mini-proteínas: github.com/hunter-heidenreich/mini-proteins/
Nicole Hall 
Eli Cruz 
Audrey Ramos
Esse guia é muito prático! Eu sempre achei complicado configurar o Gromacs com GPU no HPC, mas usando o Singularity parece bem mais acessível. A parte de não precisar de acesso root é uma mão na roda, principalmente em ambientes compartilhados. Vou testar isso agora mesmo!
Esse guia é bem prático! Eu sempre achei complicado configurar o Gromacs com GPU no HPC, mas usando o Singularity parece muito mais acessível. A parte de não precisar de acesso root é uma mão na roda, especialmente em sistemas compartilhados. Vou testar isso nas próximas semanas e volto para compartilhar minha experiência!